華西醫院起源于美國、加拿大、英國等國基督教會1892年在成都創建的仁濟、存仁醫院。華西醫院感染性疾病中心是我國西南地區感染性疾病疑難重癥診治中心，目前設有傳染病房、感染病房及感染性疾病研究室。中心現有開放床位150張，并設有名老專家門診、肝炎門診、感染門診、腸道門診；年出院病人3500余例次，年門診量8萬余人次，其中肝炎門診約6萬人次。
傳染病房主要診治法定傳染病，如：病毒性肝炎、艾滋病、流行性乙型腦炎、流行性腦脊髓炎、細菌性痢疾、傷寒等。感染病房主要診治除法定傳染病外的各類細菌、真菌、病毒、衣原體、支原體、立克次體、螺旋體、寄生蟲所致的各系統感染病。尤其對發熱待診、各類耐藥菌感染、導管相關性感染、免疫功能低下者（器官移植術后、長期應用免疫抑制劑者、腫瘤患者）感染、肺外結核病、寄生蟲感染等診治具有豐富的經驗。
感染性疾病中心初步設置亞專業為：慢性肝炎抗病毒治療、終末期肝病的診治、肝硬化、乙肝病毒感染垂直傳播的阻斷、深部真菌感染、耐藥性細菌感染、器官移植后感染、肺外結核病、艾滋病與新發疾病及突發公共衛生事件等。