在北京設有傳染病科的公立醫院中，首都醫科大學附屬北京佑安醫院是比較資深的知名醫院。
首都醫科大學附屬北京佑安醫院是一家以感染、傳染及急、慢性相關性疾病群體為主要服務對象和重點學科，集預防、醫療、保健、康復為一體的大型綜合性醫學中心。醫院創建于1956年，占地面積52250平方米，目前編制床位750張。擁有肝病內外科、肝移植、腫瘤微創治療、免疫與生物治療、感染與艾滋病診治等國內領先學科。
感染中心目前是首都醫科大學附屬北京佑安醫院最大的臨床中心，下設感染一科、二科、三科（內含ICU）三個病房以及性病艾滋病門診、皮膚科門診、性病艾滋病實驗室和佑安愛心家園；是首都醫科大學傳染病學系主要組成部分、傳染病博士學位和皮膚性病學碩士學位授予點；是北京市突發/新發傳染病救治的定點醫院科室，先后被授予北京市感染性疾病創新工作室、北京市艾滋病重點實驗室和北京市艾滋病診療中心稱號；是北京佑安醫院規模最大、功能最全的中心，也是院重點科室，連續多年被評先進集體；感染中心也是目前國內規模最大、收治病種最復雜、任務最重的感染性疾病診療和培訓教育基地，共有醫護人員141名，其中主任醫師13名，副主任醫師6名，正教授1名，副教授7名。博導1名，碩導5名，博士22名，碩士23名。另有海外合作教授5名和客座教授1名。
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