華西醫院起源于美國、加拿大、英國等國基督教會1892年在成都創建的仁濟、存仁醫院；華西臨床醫學院起源于1914年的華西協合大學醫科，是由美、加、英等國教會按西方醫學教育模式建立的醫學院。華西醫院神經內科創建于1954年。神經內科在全院最早開展整體護理模式病房，現開放床位220張，2010年出院病人9,600余人次。
神經內科年門診量超180,000人次，設有腦血管病、癲癇、頭暈頭痛、認知障礙、帕金森病、運動神經元疾病、脊髓與脫髓鞘疾病、周圍神經與肌肉疾病等專病門診，為患者提供腦卒中（中風）、頭暈頭痛診斷、治療（包括血管內介入支架置入）與預防；癲癇特別是難治性癲癇的診斷治療與手術前評估；帕金森病診斷治療與手術前評估；認知障礙、運動神經元疾病、脊髓炎等疾病的診斷與治療；多發性硬化等脫髓鞘疾病的診斷治療與預防；肌張力障礙的診斷分類與治療，包括肉毒素治療面、頸部肌張力障礙等；并具備神經、肌肉活檢等病理診斷技術對遺傳性及其他類型周圍神經與肌肉疾病進行診斷、分類、咨詢與治療。