在北京設有生殖科的公立醫院中，北醫三院是知名醫院，北醫三院具有國內領先、國際先進的生育健康疑難危重癥診療水平。
北醫三院生殖醫學中心是中國大陸第一例試管嬰兒誕生地，集醫、教、研為一體，是世界上診療規模最大、技術最全面的生殖健康研究中心，圍繞生殖內分泌和不孕癥疾病的臨床診療及其臨床應用型基礎研究進行了大量系統的工作，近三年門診量1,796,368人次，完成新鮮IVF周期52,472個，是國內首批生殖醫學臨床培訓基地，先后誕生了我國大陸首例和第二例試管嬰兒、首例贈卵試管嬰兒、首例凍融胚胎試管嬰兒及世界第二例、國內首例“三凍”試管嬰兒等。
開展臨床治療方法改進的應用研究，體外常規受精、單精子卵細胞內注射、胚胎植入前遺傳學診斷、輔助孵化、卵母細胞體外成熟培養、囊胚培養、卵子冷凍等所有國際先進的輔助生殖技術均已在中心廣泛應用。同時，在生殖障礙性疾病、妊娠相關疾病、胎源性疾病、生育力保護保存、輔助生殖技術安全性及新技術研發等方面取得了一系列重要進展，為臨床診療策略的修訂完善提供了高質量的循證醫學證據，提高女性生殖障礙性疾病診療水平。治療全國各地轉診重度卵巢過度刺激綜合征、合并血栓栓塞、多胎妊娠減胎術等患者，專科疑難病癥患者、疑難病癥外省就診患者占比超過半數。
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